I cataloghi cartacei consultabili in biblioteca sono suddivisi in generali e speciali (manoscritti, incunaboli, materiali grafici, musica ecc. ).

Tra i cataloghi generali è consultabile online il Catalogo collettivo delle biblioteche di Padova (fino al 1968).

Tra i cataloghi speciali sono inclusi i cataloghi storici a volumi tuttora in uso consultabili in sala manoscritti e disponibili anche on-line in versione digitalizzata.

Il catalogo opac del sistema bibliotecario padovano comprende le opere entrate in biblioteca dal 1992. È in corso un recupero retrospettivo delle notizie catalografiche giunto al 1978.

I cataloghi editi a stampa sono elencati tra le pubblicazioni della biblioteca.